
تعداد نشریات | 43 |
تعداد شمارهها | 1,704 |
تعداد مقالات | 13,955 |
تعداد مشاهده مقاله | 33,465,990 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 13,269,537 |
جداسازی و شناسایی سویه بومی قارچی Aspergillus niger ZRS14 با قابلیت تحمل پذیری بالا به یون روی و کاربرد سوپرناتانت آن در سنتز خارج سلولی نانو ذره اکسید روی | ||||||||||||||||||||||||||
زیست شناسی میکروبی | ||||||||||||||||||||||||||
مقاله 4، دوره 2، شماره 7، آبان 1392، صفحه 29-44 اصل مقاله (608.51 K) | ||||||||||||||||||||||||||
نویسنده | ||||||||||||||||||||||||||
مراحم آشنگرف* | ||||||||||||||||||||||||||
استادیار میکروبیولوژی، دانشگاه کردستان، ایران | ||||||||||||||||||||||||||
چکیده | ||||||||||||||||||||||||||
مقدمه : نانوذره اکسید روی کاربرد وسیعی در زیست واکنشگرها، اپتیک، مکانیک، مغناطیس و انرژی، پزشکی و بهداشتی دارد. در ساخت نانوذرات روی به روشهای فیزیکی- شیمیایی، مشکلاتی از قبیل آلودگی محیط زیست، هزینه بر و پیچیده بودن فرآیند سنتز وجود دارد. بنابراین، نیاز به توسعه روشهای زیستی تولید نانوذرات از نظر دستیابی به ذراتی متحد الشکل، مصرف انرژی پایین، خلوص بالا، آلودگی زیست محیطی کمتر و سهولت کار وجود دارد. این تحقیق بر غربالگری و جداسازی سویههای بومی قارچی با قابلیت تحمل پذیری بالا به یون سمی روی و امکان استفاده از ترشحات قارچی بهعنوان کاتالیزورهای زیستی برای سنتز خارج سلولی نانوذرات اکسید روی متمرکز شده است . مواد و روش ها: در یکسری آزمایشهای غربالگری تعداد 15 سویه قارچی براساس مشاهدات میکروسکوپی، ماکروسکوپی و آزمایشهای ریخت شناسی تشخیصی، از خاکهای معادن روی و سرب انگوران زنجان، براساس تکنیک غنی سازی انتخابی، جداسازی شدند. تحملپذیری ذاتی سویههای جدا شده نسبت به یون سمی روی در محیطهای کمپلکس و سنتتیک به روش رقت در آگار تعیین شد. سوپرناتانتها ی حاصل از قارچهای جداسازی شده با محلول استات روی در شیکر انکوباتوردار به مدت 72 ساعت گرماگذاری شدند و گونه قارچی که قادر به سنتز نانوذرات اکسید روی بود، شناسایی شد. نانوذره اکسید روی تشکیل شده در محلول واکنش زیست تبدیلی با استفاده از روشهای اسپکتروفتومتری، طیف سنجی و میکروسکوپی بررسی شد . نتایج: از میان 15سویه قارچی غربالگری شده، سویه ZRS14 که دارای بالاترین تحمل پذیری نسبت به یون سمی روی بود، بهعنوان سویه منتخب از نظر صفات فیزیولوژیک، بیوشیمیایی و همچنین، فیلوژنی و مولکول تحت عنوان Aspergillus niger strain ZRS14 شناسایی و در بانک جهانی اطلاعات ژنی NCBI ، با شماره قابل دسترسی KF414527 ، ثبت شد. در ادامه این تحقیق، سوپرناتانت حاصل از قارچ A . niger ZRS14 جداسازی شده، با محلول استات روی (با غلظت نهایی 250 میلیگرم در لیتر یون روی) در شیکر انکوباتوردار با دور rpm 150 و به دور از نور، در دمای 28 درجه سانتیگراد به مدت 72 ساعت گرماگذاری شد. سپس، بررسی تولید نانوذرات بهصورت ماکروسکوپی با تغییر رنگ محلول واکنش، بررسی طیف سنجیUV - vis مربوط به پلاسمون رزونانس سطحی نانوذرات، تحلیل طیف پراکندگی عنصری اشعه ایکس ( XRD ) و میکروگرافهای بدست آمده از تصاویر میکروسکوپ الکترونی SEM ، انجام شد. یافتههای بدست آمده نشان داد که سوپرناتانت جمع آوری شده از قارچ A . niger ZRS14 ، قادر به سنتز نانوذرات اکسید روی با توزیع کمابیش باریک اندازه ذرات و متوسط اندازه ذرات 32 نانومتر بود . بحث و نتیجه گیری: با توجه به سنتز خارج سلولی نانوذره اکسید روی، می توان امیدوار بود از سویه بومی A. n iger ZRS14 غربالگری شده در پژوهش اخیر، بهعنوان یک بیوکاتالیزور کارآمد و سازگار با محیط زیست برای تهیه زیستی نانوذرات فلزی اکسید روی در مقیاسهای بزرگتر از مقیاس آزمایشگاهی استفاده شود . | ||||||||||||||||||||||||||
کلیدواژهها | ||||||||||||||||||||||||||
الگوی تحمل پذیری؛ سنتز زیستی؛ نانوذرات اکسید روی؛ Aspergillus niger ZRS14 | ||||||||||||||||||||||||||
اصل مقاله | ||||||||||||||||||||||||||
مقدمه فناوری نانو درسه سطح تولید مواد، وسایل، دستگاهها و سیستمها بکار گرفته میشود. آنچه باعث ظهور علم نانو فناوری شده، نسبت بالای سطح به حجم است که باعث شده مواد در مقیاس نانو شروع به تغییر رفتار کرده و رفتار سطح بر رفتار توده ای غلبه کند (1 و 2). در واقع در این مقیاس قوانین فیزیک کلاسیک از بین رفته و قوانین فیزیک کوانتومی وارد صحنه میشود. تقریبا وقتی به مقیاس نانو میرسیم خواص فیزیکی-شیمیایی و حتی رنگ، نقطه ذوب و خواص شیمیایی کاملا متحول میشود. افزایش نسبت سطح به حجم باعث میشود که اتمهای واقع در سطح نسبت به اتمهای درون حجم ذرات، اثر بیشتری روی خواص فیزیکی ذرات داشته باشند (3). این ویژگی واکنش پذیری ذرات را به شدت افزایش داده به گونه ای که این ذرات به شدت تمایل به آگلومراسیون دارند. مثلا نانوذرات فلزی به محض قرارگیری در برابر هوا به شدت اکسیده میشوند. از این خاصیت بهعنوان واکنشگرهای شیمیایی بسیار قوی میتوان استفاده کرد و یا در تولید کامپوزیتها با استفاده از این ذرات، می توان پیوندهای شیمیایی مستحکمتری بین ماده زمینه و ذرات برقرار نمود که در این صورت استحکام کامپوزیت به شدت افزایش مییابد (4). افزایش نسبت سطح به حجم علاوه برافزایش واکنش پذیری ذرات، فشارسطحی را تغییر داده و باعث میشود که فاصله بین اتمهای ذرات با کاهش اندازه ذره کاهش یابد. البته این امر برای نانوذرات فلزی صادق است و درمورد نیمههادیها و اکسیدهای فلزی با کاهش اندازه ذره فاصله بین اتمها افزایش مییابد. تغییر در فاصله بین اتمهای ذرات و نسبت بالای سطح به حجم تأثیرات متقابلی بر روی خواص نوری، مغناطیسی، الکترونیکی و ترمودینامیکی ماده خواهد داشت. نانوذرات که شامل: نانوذرات فلزی، نیمههادیها و اکسیدهای فلزی هستند، بهعنوان زیست واکنشگرهای[1] قدرتمند عمل نموده که راندمان واکنشهای شیمیایی را به شدت افزایش داده و همچنین، به میزان چشمگیری از تولید مواد زاید در واکنشها جلوگیری میکنند (2 و 4). بکارگیری نانوذرات در تولید مواد دیگر استحکام آنها را افزایش داده، وزن آنها را سبک کرده، مقاومت شیمیایی و حرارتی آنها را بالا برده و واکنش آنها را در برابر نور و تشعشعات دیگر تغییر میدهد. بنابراین، در تولید نانوکامپوزیتها استفاده میشوند (5 و 6). درسالهای اخیرکوششهای بسیار زیادی برای تولید نانوذرات به علت خواص ویژه نوری، شیمیایی، الکتریکی و فوتوالکتریکی آنها انجام شده است که موید استفادههای گوناگون این مواد در زمینههایی چون کاتالیستها، اپتیک، دانش داروهای زیستی، مکانیک، مغناطیس و انرژی است (7). روشهای معمول فیزیکی- شیمیایی تولید نانوذرات اکسید روی شامل: رسوب فیزیکی بخار، چگالش گازخنثی، فرآیند سل- ژل (رسوبدهی محلول شیمیایی)، احیای الکتروشیمیایی، تجزیه نوری وحرارتی، میکرو امولسیون و احیای شیمیایی است (8، 9و 10). بیشتر تکنیکهای بالا با وجود سرعت بالا دارای معایبی از جمله هزینه بالا، مصرف مواد و انرژی بالا، آلودگی زیست محیطی و ایجاد ذرات بی کفایت (توزیع نامناسب ذرات و پایداری پایین) هستند. بنابراین، تقاضا برای پیشبرد روشهای سنتزی کم هزینه، مطمئن و محافظ محیط زیست وجود دارد و این امر نقش روشهای زیستی تولید نانوذرات را پر رنگ تر می کند (4 و 11). سیستمهای زیستی از قبیل گیاهان، جلبکها، کپکهای رشته ای، مخمرها و باکتریها قادر به تولید نانوذرات فلزی هستند که در این میان قارچهای رشته ای به علت وجود مقادیر در خور توجهی از آنزیمها و پروتئینهای ترشحی ویژه دراین میکروارگانیسمها، سهولت کار با آنها در آزمایشگاه، سهولت دسترسی به مقادیر زیادی توده زیستی[2] و شاید از همه مهمتر فرآیند پردازش پایین دستی[3] ساده از جذابیت بالاتری برخوردار هستند (12 و 13). مزایای تولید زیستی نانوذرات برتولید شیمیایی عبارتند از: تمیز بودن بسیاربالا، سازگاری بالا با محیط زیست، توزیع مناسب ذرات[4]، پایداری بالا، انعطافپذیری بیشتر، انتشار نور بهتر و آسانی تولید است (14). نانوذره روی از عناصر پایه علم نانو است که به علت کاربردهای فراوان آن در صنایع مختلف مورد توجه قرار گرفته است. با توجه به ویژگیهای نوری و الکتریکی منحصر بفرد نانوذره اکسید روی، از این نانوذره در پوششهای رسانای اکسیدی با قابلیت عبور دهی بالا برای سلولهای خورشیدی، حسگرهای گازی، آشکار سازهای نوری فرابنفش، جاذب شیمیایی، کاتالیستهایی برای هیدروژن دار کردن در فاز مایع و کاتالیستهایی برای تخریب نوری به جای نانو ذرههای تیتانیوم نام برد (15 و 16). از نانوذرات اکسید روی همچنین بهعنوان واکنشگرهای شیمیایی بسیار قوی برای افزایش بازده واکنشهای شیمیایی، تولید نانوکامپوزیتها و ساخت شیشههای ضد آفتاب استفاده میشود (17). در دو دهه گذشته مطالعات زیادی برای تولید میکروبی نانوذرات فلزی (طلا، نقره، روی، منگنز، مس، کروم و پلاتینیوم)، نیمههادیها (سولفید روی، سولفید کادمیوم، سولفید سرب و سولفید آهن) و اکسیدهای فلزی (زیرکونیوم، اکسید منگنز، مگنتیت و اکسید اورانیوم) انجام شده که به شناسایی میکروارگانیسمهای مختلف شامل: باکتریها، قارچهای رشته ای و مخمرهایی از قبیل
مواد و روشها مواد شیمیایی و محیطهای کشت استفاده شده نمک استات روی دو آبه[8] با خلوص 98 درصد از شرکت سیگما- آلدریچ[9] خریداری شد. محلولهای استوک روی در آب مقطر حل شده و بعد از فیلتراسیون بهوسیله فیلترهای سرنگی 22/0 میکرونی در دمای 4 درجه سانتیگراد و در تاریکی نگهداری شدند. محیطهای کشت جامد و مایع سیب زمینی دکستروز آگار[10] و براث[11] حاوی 4 گرم در لیتر عصاره خیسانده سیب زمینی، 20 گرم در لیتر گلوکز و 15 گرم در لیتر آگار با اسیدیته برابر 6/5، از شرکت مرک[12] خریداری شد. آنتی بیوتیک کلرامفنیکل از کمپانی هایمدیا[13] تهیه شد. محلول استوک کلرامفنیکل (mg/l34) در اتانول تهیه و سپس توسط فیلترهای غشایی میلیپور استریل شده و تا زمان استفاده در فریزر منهای 20 درجه سانتیگراد نگهداری شد. بیشتر مواد استفاده شده در واکنش زنجیره ای پلیمرآز از شرکت سیناژن[14] تهیه شد. سایر مواد شیمیایی استفاده شده با درجه خلوص بالا بودند. در تمامی مراحل آزمایشهای مربوط به سنتز زیستی نانوذرات اکسید روی از آب مقطر دو بار تقطیر استفاده شد. روش نمونهگیری و غربالگری سویههای قارچی تحمل پذیر به فلز سمی روی برای جداسازی سویههای قارچی با پتانسیل تحمل پذیری به یون روی، نمونههای خاک از معادن روی و سرب انگوران، واقع در استان زنجان، جمع آوری شد. نمونه برداری در ظروف استریل انجام شد. نمونهها سریعا به آزمایشگاه انتقال داده و تا زمان استفاده در یخچال 4 درجه سانتیگراد نگهداری شدند. از نمونههای خاک جمع آوری شده سری رقت از 1-10 تا 6-10تهیه شد. از هر رقت 300 میکرولیتر در محیطهای کشت PDA آگار حاوی 100 میلی گرم در لیتر یون روی به روش کشت چمنی [15]با میله ی سرکج کشت داده و پلیتهای مذکور به مدت 5 روز تحت شرایط تاریکی در انکوباتور 28 درجه سانتیگراد گرماگذاری شدند. برای جلوگیری از آلودگیهای باکتریایی به محیطهای کشت اتوکلاو شده، آنتی بیوتیک کلرامفنیکل در غلظت نهایی10 میلیگرم در لیتر اضافه شد. پس از حدود 5 روز کلونیهای ظاهر شده روی پلیتها خالصسازی شدند. سپس تک اسپور کردن کلونیهای خالصسازی شده انجام شد تا قارچهایی خالص و حاصل از یک اسپور به دست آیند. شناسایی اولیه سویههای قارچی جدا شده براساس ویژگیهای رشد بر روی محیطهای کشت جامد، ظاهر میکروسکوپی آنها و همچنین خصوصیات ریخت شناسی آنها انجام شد (19). پروفایل تحمل پذیری سویههای قارچی غربالگری شده نسبت به یون سمی روی تحمل پذیری سویههای قارچی غربالگری شده با روش رقت در آگار تعیین شد (20). برای این منظور به ارلنهای 250 میلیلیتری حاوی 30 میلیلیتر از محیطهای کشت کمپلکس PDA و سنتتیک M9 با اندکی تغییرات (21) (گلوکز 5 گرم در لیتر، کلرید آمونیوم 5/2 گرم در لیتر، سولفات منیزیم هفت آبه 5/0 گرم در لیتر، سدیم کلراید 5/0 گرم در لیتر، کلرید کلسیم 015/0 گرم در لیتر، سولفات آهن هفت آبه 03/0 گرم در لیتر و بافر نمکی فسفات 100میلی مولاری با اسیدیته برابر 6/5)، غلظتهای خاصی از یون روی (250، 500، 750، 1000، 1250، 1500، 1750 و 2000 میلی گرم در لیتر) بصورت جداگانه اضافه شده و داخل پلیتهای شیشه ای به قطر 10 سانتیمتر ریخته شد. سپس بهوسیله سمپلر، 100 میکرولیتر از سوسپانسیون قارچی ازمحیط مایع PDB که قارچ مورد نظر درآن رشد کرده (رشد لگاریتمی) و تراکم آن cfu/ml106× 5/1، با دانسیته سلولی[16] برابر 12/0بود، بهعنوان مایه تلقیح[17] استاندارد بصورت کشت نقطه ای بر روی محیطهای کشت محتوی آگار کمپلکس و سنتتیک، قرار گرفت. پلیتها پس از 7 روز گرما گذاری در 28 درجه سانتیگراد در تاریکی، مطالعه شدند. از محیطهای کشت تلقیح شده فاقد یون روی، بهعنوان کنترل استفاده شد. تمامی آزمایشها سه بار متوالی تکرار شدند. شناسایی سویه قارچی ZNRS14 با استفاده از روشهای ریختشناسی و مولکولی شناسایی اولیه سویه قارچی ZRS14 براساس مشاهدات ماکروسکوپی، مشاهدات میکروسکوپی و بررسی شاخصهای ریخت شناسی مختلف از جمله رنگ، ساختار میسیلیوم، الگوی تشیکل اسپور، نحوه استقرار هیفها و مشاهده انشعابات هیفها انجام شد (19). سپس، برای تایید دقیق جنس و گونه سویه مذکور از تعیین ترادف ژن rDNA استفاده شد. استخراج DNA ژنومی سویه ZRS14 به روش تخریب با کمک ازت مایع و با استفاده از کیت استخراج DNA (کمپانی هایمدیا) انجام شد. به منظور استخراج DNA از سویه قارچی ZRS14، قارچ مورد نظر در محیط کشت PDB کشت داده شد. پس از جداسازی میسیلیوم از محیط کشت با استفاده از سانتریفیوژ یخچالی (g×3000، 10 دقیقه، 4 درجه سانتیگراد) و شستشوی آن با آب مقطر استریل، توده میسیلیومی جمع آوری شده به کمک ازت مایع خرد و سپس استخراج DNA به کمک کیت استخراج DNA مخصوص قارچها، طبق دستورالعمل شرکت سازنده کیت انجام شد. پس از تعیین کیفیت و کمیت DNA استخراجی به کمک روشهای اسپکتروفتومتری و الکتروفورز، DNA استخراج شده مورد آزمون PCR اختصاصی با استفاده از دو پرایمر همه گانی ITS3 (پرایمر رفت) سنتز خارج سلولی نانوذرات اکسید روی توسط سویه قارچی ZRS14 10 میلی گرم از اسپورهای غیرجنسی سویه قارچی ZRS14، برداشت شده از یک کشت 14 روزه بر روی محیط PDA، به یک محلول نمکی استریل حاوی 1/0 درصد تویین 80 و 85/0 درصد نمک سدیم کلراید منتقل شده و به مدت 2 ساعت بر روی یک شیکر دورانی با سرعت rpm 200 همزده شد. پس از شمارش در زیر میکروسکوپ حدود یک میلی لیتر از غلظت اسپور مورد نظر (spores/ml106 ×1) به 100 میلیلیتر محیط کشت مایع PDB درون فلاسکهای 250 میلیلیتری و تحت شرایط دمایی 28 درجه سانتیگراد و بر روی شیکر دورانی با سرعت rpm150به مدت 72 ساعت گرماگذاری شد. برای جدا کردن توده میسیلیوم قارچی از محیط کشت مایع PDB، از سانتریفیوژ یخچالی با دور rpm 5000 در دقیقه در دمای 4 درجه سانتیگراد به مدت 10 دقیقه استفاده شد. پس از سه بار شستشو با آب دو بار تقطیر استریل، 20 گرم از توده زیستی مذکور در ارلنهای 250 میلی لیتری که حاوی 100 میلی لیتر آب دو بار تقطیر استریل بود، ریخته و به مدت 72 ساعت در شیکر انکوباتوردار در دمای 28 درجه سانتیگراد و دور شیکر rpm150 قرار داده شد. پس از طی دوره گرماگذاری، توده قارچی با استفاده از فیلتراسیون به کمک کاغذ صافی واتمن جدا شد. پس از جمع آوری، از سوپرناتانت عاری از میسیلوم قارچ ZRS14 بهعنوان بیوکاتالیزور، برای سنتز زیستی نانوذرات اکسید روی استفاده شد. برای این منظور به فلاسکهای 250 میلی لیتری حاوی 100 میلی لیتر از سوپرناتانت برداشت شده قارچی، محلول استات روی (با غلظت نهایی 250 میلی گرم در لیتر یون روی) اضافه و به مدت 72 ساعت تحت شرایط دمایی 28 درجه سانتیگراد و دور شیکر rpm150 گرماگذاری شد. بطور همزمان از محلول استات روی (بدون تلقیح سوپرناتانت قارچ ZRS14) بهعنوان محیط کنترل استفاده شد. مشخصه یابی نانوذرات اکسید روی تشکیل شده تشخیص نانوذرات اکسید روی تشیکل شده در محلول واکنش زیست تبدیلی، ابتدا با استفاده از مشاهدات چشمی از طریق تغییر رنگ محلول واکنش انجام شد. سپس برای تایید مشاهدات چشمی از تکنیکهای [25]UV-vis، تحلیل طیف پراکندگی عنصری اشعه ایکس[26] و همچنین تصویر برداری با میکروسکوپ الکترونی SEM[27] استفاده شد. در مرحله اول، شکل گیری نانو ذرات اکسید روی با مشاهده تغییر رنگ محلول واکنش حاوی سوپرناتانت سویه قارچی ZRS14 و محلول استات روی مشخص شد. به منظور تعیین طیف جذبی محلول رویی حاصل از سانتریفیوژ، نمونهها با سرعت g×3000 به مدت 15 دقیقه در دمای 4 درجه سانتیگراد سانتریفیوژ شدند. سپس، تحلیلهای پراش پرتو ایکس با استفاده از XRD و مشاهدات میکروسکوپی با استفاده از میکروسکوپ الکترونی SEM با هدف بررسی وضعیت نانو کریستالهای تشیکل شده و همچنین بررسی ریختشناسی آنها انجام شد. برای این منظور، ابتدا سوپرناتانت عاری از کشت قارچی از فیلترهای سرنگی 22/0 میکرونی عبور داده شد و سپس با هدف رسوب نانو ذرات اکسید روی، نمونهها با سرعت ×g 15000 به مدت 30 دقیقه در دمای 4 درجه سانتیگراد، سانتریفیوژ شدند. پس از شستشوی رسوب حاصل با آب مقطر دو بار تقطیر استریل، نمونهها در آون 50 درجه سانتیگراد به مدت 24 ساعت خشک و تحلیل شدند.
نتایج جداسازی و غربالگری سویههای قارچی با پتانسیل تحمل پذیری بالا به یون روی با توجه به سمیت یون روی بر روی سلولهای میکروبی، شناسایی و تشخیص سویههای میکروبی با پتانسیل تحمل پذیری بالا به یون سمی روی، میتواند بهعنوان گام نخست ما را به گزینش سویه برتر هدایت کند. در این راستا، 15 سویه قارچی (نامگذاری شده تحت عنوان ZRS1-ZRS15) براساس مشاهدات میکروسکوپی، ماکروسکوپی و آزمایشهای ریختشناسی تشخیصی اولیه، از خاکهای معادن روی و سرب انگوران زنجان، براساس تکنیک غنی سازی انتخابی، جدا سازی شدند. پروفایل تحمل پذیری ذاتی سویههای قارچی جدا شده نسبت به یون سمی روی، در محیطهای کمپلکس و سنتتیک با روش رقت در آگار تعیین شد (شکل 1). همانگونه که در شکل 1 مشاهده می شود، میزان تحمل پذیری سویههای بومی قارچی جدا شده در محیطهای سنتتیک و کمپلکس به ترتیب بین 250 تا 1750 میلی گرم در لیتر و 500 تا 2000 میلیگرم در لیتر تعیین شد. در بین سویههای مذکور، سویه قارچی ZRS14 که بیشترین میزان تحمل پذیری را نسبت به یون سمی روی هم در محیطهای کمپلکس (بالاتر از 2000 میلی گرم در لیتر) و هم در محیطهای سنتتیک (بالاتر از 1750 میلی گرم در لیتر) را نشان داد، بهعنوان سویه برتر مورد مطالعات فنوتیپی و مولکولی برای تعیین هویت از نظر جنس و گونه قرار گرفت. شناسایی ریخت شناسی و مولکولی سویه قارچی ZRS14 سویه ZRS14 که براساس تحلیل پروفایل تحملپذیری دارای بیشترین تحمل پذیری به یون سمی روی بود انتخاب و براساس ویژگیهای ریخت شناسی تشخیصی متداول قارچها شناسایی شد (19) و بهطور موقت بهعنوان Aspergillus niger تشخیص داده شد. ویژگیهای ریختشناسی و کشتی این سویه در شکل 2 نشان داده شده است. سویه ZRS14، از نظر ماکروسکوپی، دارای کلونی کرکی و سیاه رنگ، اسپورهای غیر جنسی گرد و همچنین از نظر شکل ظاهری دارای میسیلیوم با تیغه میانی و کونیدیوفور است که بر روی آن وزیکول تقریبا گرد قرار گرفته است. شکلهای میسلیومی بسته به شرایط فیزیکی- شیمیایی موجود در کشت می تواند به اشکال رشته ای و گلوله ای با انشعابات هیفی مشاهده شود (شکل 2).
شکل 1- پروفایل تحمل پذیری به یون روی در سویه های قارچی جدا شده از خاکهای معادن روی و سرب
شکل 2- ویژگیهای ریخت شناسی سویه قارچی A. niger ZRS14. A: شکل میکروسکوپی اسپور غیر جنسی سویه ZRS14 B1 وB2: اشکال میکروسکوپی میسیلیوم های سویه ZRS14 به ترتیب بعد از 48 ساعت رشد در محیط PDB حاوی 250 میلی گرم در لیتر یون روی و PDB بدون یون روی و C: رشد سویه ZRS14 در محیط کشت جامد PDA.
شکل 3- الکتروفورز محصول PCR ژنوم سویه قارچی ZRS14. ستون 1: سویه ZRS14، ستون 2: شاهد مثبت (Aspergillus niger PTCC1243)، ستون 3: شاهد منفی.
همانگونه که در شکل 3 مشاهده میشود، محصول PCR در ناحیه 350 جفت بازی نمایان شده است که حکایت از خلوص DNA مورد استفاده برای تعیین توالی دارد. پس از مشخص شدن توالی ژن سویه مذکور و بلاست نمودن آن در سایت اینترنتی NCBI، قارچ مورد نظر تعیین هویت شد. براساس نتایج حاصل از بلاست این سویه دارای مشابهت 6/98 درصدی با گونه ثبت شده Aspergillus niger (با شماره دسترسیKC763981 در سایت اینترنتی NCBI) است. در ادامه با ترسیم درختچه فیلوژنی بر پایه روش neighbor-joinig با استفاده از نرم افزار MEGA-4 مشخص شد که این سویه در میان گونههای ثبت شده نزدیکترین شباهت ژنتیکی را با گونهAspergillus nigerدارد. درختچه فیلوژنی سویه قارچی ZRS14 در شکل4 نشان داده شده است.
شکل 4- درخت فیلوژنتیک سویه قارچی ZRS14 رسم شده به روشNeibour-joining که با گونه های مربوط در جنس Aspergillus نزدیکی نشان داد. درخت فیلوژنتیک با الگوریتم دو پارامتری کیمورا ترسیم شد. بررسی اعتبار شاخههای درخت با استفاده الگوریتم Bootstrap analysis و با 100 بار نمونهگیری انجام شد. اعداد داخل پرانتز به شماره ژنی قابل دستیابی در بانک اطلاعات ژنی NCBI مربوط است. Aspergillus flavus به عنوان outgroup قرار داده شد.
کاربرد سوپرناتانت Aspergillus niger isolate ZRS14 در تولید خارج سلولی نانوذرات اکسید روی سوپرناتانت عاری از میسیلیوم قارچ Aspergillus niger strain ZRS14، دارای تحمل پذیری بالا نسبت به یون روی، قادر به سنتز نانوذرات اکسید روی، در غلظت 250 میلی گرم در لیتر از یون سمی روی بود که با ایجاد تغییر رنگ محلول واکنش زیست تبدیلی از سفید به شیری شناسایی شد. در محلول کنترل (استات روی عاری از سوپرناتانت) هیچ تغییر رنگی در محلول واکنش مشاهده نشد (شکل 5). نمایان شدن رنگ شیری پس از واکنش زیست تبدیلی با استات روی بیانگر کاهش یون روی و تشکیل نانوذرات اکسید روی است. نانوذرات اکسید روی به علت تحریک ارتعاشات پلاسمون سطح بسته به اندازه ذرات تشکیل شده و همچنین ریختشناسی آنها، به رنگ سفید متمایل به شیری تا زرد هستند و همین ابزاری ساده و مناسب برای تایید اولیه نانوذرات اکسید روی در محلول واکنش زیست تبدیلی میباشند (24 و 25).
شکل 5- محلول های استات روی (غلظت یون روی 250 میلیگرم در لیتر) بدنبال اضافه کردن سوپرناتانت عاری از توده میسیلومی قارچی A. niger isolate ZRS14 در ابتدای واکنش (A)، پس از 72 ساعت واکنش زیست تبدیلی (B) و در محلول کنترل (C) ] عاری از سوپرناتانت قارچی[ بر روی شیکر مدور (150 دور در دقیقه)
در ادامه تحلیل نمونهها با اسپکتروفتومتری UV-vis، مربوط به پلاسمون رزونانس سطحی[28] نانوذرات، یک پیک جذبی مشخص را در طول موج 380 نانومتر (پیک اختصاصی برای نانوذرات اکسید روی) را نشان داد که براساس منابع معتبر بیانگر وجود نانوذرات روی در محلول واکنش زیست تبدیلی است (18، 24 و 25). در محلول کنترل (عاری از سوپرناتانت قارچی)، در طول موجهای بین 240 تا 520 نانومتر هیچ پیک جذبی مشاهده نشد (شکل6).
شکل 6- طیف های جذبی UV-vis حاصل از واکنش زیستی سوپرناتانت قارچی A. niger isolate ZRS14 با محلول استات روی. (A) محیط کنترل (محلول استات روی فاقد سوپرناتانت قارچی) و (B) محلول استات روی تلقیح شده با سوپرناتانت قارچی بعد از 72 ساعت واکنش زیست تبدیلی.
در ادامه این پژوهش، تحلیل XRD به منظور اثبات نانوکریستالهای فلزی اکسید روی انجام شد. براساس نتایج بدست آمده که در شکل (7) نشان داده شده است، نانوذرات کریستالی اکسید روی در سطوح 100، 002، 101،102، 110، 103 و 112 پیکهای را نشان داد که با نمونه استاندارد نانوکریستالهای اکسید روی کاملا همخوانی دارد (11 و 26).
شکل7- الگوی XRD نانوذره اکسید روی که در محلول واکنش زیست تبدیلی توسط سوپرناتانت قارچی A. niger isolate ZRS14 ساخته شده است.
تصاویر بهدست آمده از میکروسکوپ الکترونی SEM نیز سنتز نانوذرات اکسید روی با توزیع کمابیش باریک اندازه ذرات و متوسط اندازه ذرات 32 نانومتر و اشکال کروی را نشان داد (شکل 8).
شکل 8- میکروگراف های SEM حاصل از نانوذرات اکسید روی سنتز شده توسط سویه قارچی Aspergillus niger strain ZRS14.
بحث و نتیجه گیری میکروارگانیسمهای مختلف شامل: باکتریها، مخمرها، قارچها و اکتینومیستها برای سوخت و ساز و انجام فرآیندهای حیاتی خود از منابع آلی و معدنی موجود در محیط تغذیه میکنند. این ارگانیسمها طی فرآیندهای متفاوت، هنگامی که در معرض یونهای فلزی قرارمیگیرند، آنها را در درون یا بر روی دیواره سلولی خود انباشته میکنند. این انباشتگی بیشتر به تولید ذراتی منجر میشود که در اندازههای نانوذرات بستهبندی میشوند (3). توسعه روشهای مختلف تولید نانوذرات از نظر دستیابی به ذراتی با ترکیب و اندازه دانه معین و توزیع مناسب، مصرف انرژی پایین و سهولت کار در حال بررسی و مطالعه است. با توجه به نیاز روز افزون بشر برای ساخت ابزار و وسایل با آلودگی زیست محیطی کمتر، محققان به استفاده از سامانههای زیستی روی آورده اند. محققان برای ساخت نانوذرات موفق به جداسازی موجودات زنده تک سلولی و پرسلولی شدهاند که قادرند بصورت داخل یا خارج سلولی این نانوذرات را تولید نمایند. عده ای از جانداران موجود در طبیعت قادر به تولید مواد آلی در داخل و خارج سلول هستند. مثلا باکتریهای مگنتو تاکتیک میتوانند نانوذرات مغناطیسی تولید کنند، دیاتومهها مواد سیلیسی تولید نموده و موجودات زنده چند سلولی برای ساخت ترکیبات آلی یا معدنی مرکب و پیچیده بکار گرفته شدهاند. این ترکیبات معدنی زیستی شامل: مواد معدنی معمولی و برخی از ترکیبات آلی مخصوص مانند پروتئین، چربی و پلی ساکاریدها هستند (3 و 4). تهیه نانوذرات اکسید روی به دلیل خواص نوری، الکتریکی، شیمیایی و فتوشیمیایی منحصر بفردی که دارد، جالب توجه است. نانوکریستالهای فلزی اکسید روی در کاتالیز و ساخت سنسورها و زیست واکنشگرها، ساخت نیمههادیها[xxix] و فیلتر کننده [xxx]UV استفاده شده و همچنین دارای کاربردهای گسترده ای در صنایع علوم زیستی، بهداشتی و آرایشی، شیمیایی، نوری و الکتریکی و صنایع نساجی و پزشکی هستند (27). با توجه به مشکلات زیادی که در روشهای فیزیکی و شیمیایی برای سنتز نانوذرات وجود دارد، استفاده از میکرواورگانیسمهای محتلف بهعنوان نانوکارخانههای بالقوه سبز برای سنتز نانوذرات همسو و سازگار با محیط زیست، پایدار و همچنین مقرون به صرفه بودن از نظر اقتصادی پیشنهاد شده است (28). درمیان میکروارگانیسمهای مختلف استفاده از قارچهای رشتهای ازجایگاه ویژه ای برخوردار است. قارچها به دلیل توانایی شان در سنتز آنزیمها و پروتئینهای ترشحی فراوان و همچنین سنتز نانوذرات خارج سلولی پربازده که از نظر اقتصادی مقرون به صرفه هستند، کاندیدای مناسبی برای تولید زیستی نانوذرات فلزی هستند. در تحقیقاتی که در ارتباط با پتانسیل سویههای قارچی در تولید انواع نانوذرات فلزی انجام شده، قارچهایی از جنس Verticillium sp., تشکر و قدردانی این تحقیق در قالب طرح پژوهشی به شناسه 1391/42380/4 با حمایت مالی معاونت پژوهشی دانشگاه کردستان انجام شده است. بدین وسیله از معاونت پژوهشی دانشگاه کردستان تشکر و قدردانی میشود.
[1]. Biocatalysts [2]. Biomass [3]. Downstream process [4]. Monodispersity [5]. Prasad [6]. Jha [7]. Jain [8]. [Zn (CH3COO) 2 (H2O) 2] [9]. Sigma-Aldrich, St. Louis, MO [10]. Potato Dextrose Agar=PDA [11]. Potato Dextrose Broth=PDB [12]. E. Merck, Darmstadt, Germany [13]. HiMedia, Mumbai, India [14]. Cinnagen company, Iran [15]. Spread plate method [16]. Optical density=OD530nm [17]. Inoculum [18]. Initial denaturation [19]. Annealing [20]. Final elongation [21]. Fermentase [22]. Macrogen [23]. NCBI BLAST (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast) [24]. MEGA. 4 (http://www.megasoftware.net/) [25]. Analytik Jena's spectrophotometer SPECORD 210,Carel Zeiss Technology, Germany [26]. X-ray Diffractometer, D8ADVANCE, Bruker, Germany [27]. KYKY-EM3200, KYKY Technology Development Ltd., China [28]. Surface Plasmon Resonance [xxix]. Quantum dots=Semiconductor [xxx]. UV filtering [xxxi]. Raliya [xxxii]. Tarafdar [xxxiii]. Jain et al [xxxiv]. Gade [xxxv]. Soni | ||||||||||||||||||||||||||
مراجع | ||||||||||||||||||||||||||
References (1) Jain PK, Huang X, EI-Sayed IH, EI-Sayed MA. Review of some interesting Surface Plasmon Resonance- enhanced properties of noble metal nanoparticles and their applications to biosystems. Plasmonics; 2007;2 (3): 107-18. (2) Bhattacharya R, Mukherjee P. Biological properties of “naked” metal nanoparticles. Adv Drug Delivery Rev; 2008; 60 (11): 1289–306. (3) Narayanan KB, Sakthivel N. Biological synthesis of metal nanoparticles by microbes. Adv ColloidInterface Sci; 2010; 156 (1-2): 1-13. (4) Thakkar KN, Mhatre SS, Parikh RY. Biological synthesis of metallic nanoparticles. Nanomedicine: NBM; 2009; 6 (2): 257-62. (5) Luechinger NA, Grass RN, Athanassiou EK, Stark WJ. Bottom-up fabrication of metal/metal nanocomposites from nanoparticles of immiscible metals. Chem Mater; 2010; 22 (1): 155–60. (6) Li X, Xu H, Chen Z, Chen G. Biosynthesis of nanoparticles by microorganisms and their applications. J Nano Mat; 2011; 2011: 1-16. (7) Mandal D, Bolander ME, Mukhopadhyay D, Sarkar G, Mukherjee P. The use of microorganisms for the formation of metal nanoparticles and their application. Appl Microbiol Biotechnol; 2006; 69 (5): 485–92. (8) Ge MY, Wu HP, Niu L, Liu JF, Chen SY, Shen PY, et al. Nanostructured ZnO: from monodisperse nanoparticles to nanorods. J Cryst Growth; 2007; 305 (2):162–6. (9) Shokuhfar T, Vaezi MR, Sadrnezhad SK, Shokuhfar A. Synthesis of zinc oxide nanopowder and nanolayer via chemical processing. Int J Nanomanuf; 2008; 2 (1-2):149-62. (10) Moghaddam AB, Nazari T, Badraghi J, Kazemzad M. Synthesis of ZnO nanoparticles and electro deposition of polypyrrole/ZnO nanocomposite film. Int J Electrochem Sci; 2009; 4 (2):247–57. (11) Prasad K, Jha AK. ZnO Nanoparticles: Synthesis and Adsorption Study. Natural Science; 2009; 1 (2): 129-35. (12) Ahmad A, Mukherjee P, Senapati S, Mandal D, Khan MI, Kumar R, et al. Extracellular biosynthesisof silver nanoparticles using the fungus Fusarium oxysporum. Coll Surf B; 2003; 28 (4): 313–18.
(13) Chen JC, Lin ZH, Ma XX. Evidence of the production of silver nanoparticles via pretreatment of Phoma sp.3.2883 with silver nitrate. Lett Appl Microbiol; 2003; 37 (2):105-8.
(14) Salata OV. Applications of nanoparticles in biology and medicine. J Nanobiotech;2004; 2 (3):1-6.
(15) Wang ZL. Energy harvesting for self-powered nanosystems. Nano Res; 2008; 1 (1):1-8. (16) Park S, Lee JH, Kim HS, Park HJ, Lee JC. Effects of ZnO nanopowder dispersion on photocatalytic reactions for the removal of Ag+ ions from aqueous solution. J Electroceram; 2009; 22 (1-3):105–9. (17) Lee CY, Haung YT, Su WF, Lin C-F. Electroluminescence from ZnO nanoparticles/organic nanocomposites. Appl Phys Lett: 2006; 89 (1-2): 231116-8. (18) Jain N, Bhargava A, Tarafdar JC, Singh SK, Panwar J. A biomimetic approach towards synthesis of zinc oxide nanoparticles. Appl Microbiol Biotechnol; 2013; 97 (2): 859-69. (19) Lourdes AM, Accensi F, Cano J, Cabanes FJ. Taxonomy and significance of black Aspergilla. Antonie van Leeuwenhoek; 2004;86 (1): 33–49.
(20) Washington JA, Sutter VL. Dilution susceptibility test: agar and macro-broth dilution procedures.In: Lennette EH, Balows A, Hausler JR, WJTruant, J. (Eds.) , Manual of Clinical Microbiology, 3rd ed., Washington DC; American Society for Microbiology; 1980.
(21) Sambrook J, Fritsch EF, Maniatis T. Molecular cloning: A laboratory manual. Cold Spring Harbor (NY) ; Cold Spring Harbor Laboratory; 1989. (22) White TJ, Bruns T, Lee S, Taylor JT. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. In: Innis MA, Gelfand DH, Sninsky JJ, White TJ (eds) PCR protocols: a guide to methods and applications. New York:Academic Press; 1990.
(23) Tamura K, Dudley J, Nei M, Kumar S. Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0. Mol Biol Evol; 2007; 24 (8):1596–9.
(24) Chang H, Tsai MH. Synthesis and characterization of ZnO nanoparticles having prism shape by a novel gas condensation process. Rev Adv Mater Sci; 2008; 18 (8): 734-43.
(25) Waghmare SS, Deshmukh AM, Kulkarni SW, Oswaldo LA. Biosynthesis and characterization of manganese and zinc nanoparticles. J Environ Res Technol; 2011; 1 (1): 64-9.
(26) Yang L, Wang G, Tang C, Wang H, Zhang L. Synthesis and photoluminescence of corn-like ZnO nanostructures under solvothermal-assisted heat treatment. Chem Phys Letts; 2005; 409 (1-3): 337–41.
(27) Vaseem M, Ahmad U, Yoon-Bong H. ZnO nanoparticles: growth, properties, and applications. [Dissertation]. American Scientific Publishers, USA: Chonbuk National Univ.; 2010.
(28) Prabhu S, Poulose EK. Silver nanoparticles: mechanism of antimicrobial action, synthesis, medical applications, and toxicity effects. Nano Lett; 2012; 2 (32): 1-10.
(29) Ahmad A, Senapati S, Islam Khan M, Kumar R, Ramani R, Srinivas V, et al. Intracelluar synthesis of gold nanoparticles by a novel alkalotolerant actinomycete, Rhodococcus sp. Nanotechnology; 2003; 14 (7): 824-28.
(30) Raliya R Tarafdar JC. ZnO nanoparticle biosynthesis and its effect on phosphorous-mobilizing enzyme secretion and gum contents in cluster bean (Cyamopsis tetragonoloba L.). Agric Res; 2013; 2 (1):48–57.
(31) Gade AK, Bonde P, Ingle AP, Marcato PD, Duran N, Rai MK. Exploitation of Aspergillus niger for synthesis of silver nanoparticles. J Biobased Mater Bioenergy; 2008; 3 (2): 123-29.
(32) Soni N, Prakash S. Synthesis of gold nanoparticles by the fungus Aspergillus niger and its efficacy against mosquito larvae. J Report Parasitol; 2012; 2 (1): 1-7.
| ||||||||||||||||||||||||||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 4,186 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 929 |